亚林所科研团队在无患子基因组图谱绘制中取得重要进展

图一：无患子基因组组装及标记开发利用

图二：本研究相较于已公开无患子基因组埴补的Gaps

2月17日，亚林所林木种质资源研究团队在国际权威期刊Industrial Crops & Products（中科院一区Top期刊，IF=5.6）上发表了题为“Genome assembly and SSR molecular marker development and utilization inSapindus mukorossi（无患子基因组组装及SSR分子标记开发利用）”的研究论文，该研究组装了染色体级别高质量无患子基因组，分析挖掘了油脂合成候选基因，开发验证了一套特异分子标记，为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价提供了科学依据。

无患子果皮富含皂苷，种仁含油率高，秋季叶色金黄，是我国重要的天然洗涤原料、生物质能源和彩化树种。亚林所在国内率先系统开展无患子种质资源收集保存、遗传评价和开发利用等工作，2016年在浙江安吉建成我国首个无患子国家林木种质资源库，收集保存了无患子全分布区重要遗传资源。该研究基于库存种质，结合三代测序和二代测序技术，完成了染色体级别无患子基因组组装。与以往公开的基因组相比，该研究基因组完整性（BUSCO）由83.8%提升至97.64%，并填补了4931个Gaps，极大提高了无患子基因组绘制质量。此外，通过基因注释和比对分析，研究团队挖掘出6个参与调控无患子种仁油脂合成的候选基因。该研究还基于全基因组序列，开发了20对多态性高、稳定性强的SSR标记，通过346份无患子遗传资源验证了其可靠性，并揭示了无患子及其近缘种遗传关系和种质资源丰富的遗传多样性。

亚林所已毕业硕士研究生李永祥为论文第一作者，邵文豪副研究员为通讯作者，林业所王兆山副研究员和亚林所姜景民研究员为研究提供了指导帮助。该研究得到了浙江省农业（林木）新品种选育重大科技专项（2021C02070-3-3）、国家科技基础调查专项（2019FY100803_02）和林业行业标准（2023-LY-030）等项目资助。