森环森保所在川金丝猴肠道微生物和代谢组学研究取得新进展

图1：川金丝猴肠道微生物群落组成和基因注释分类特征

图2：不同保护策略背景下川金丝猴肠道微生物的功能代谢差异

动物肠道是一个复杂的生态系统，由数以万亿计的微生物细胞组成，肠道微生物在野生动物健康、疾病易感性、栖息地退化的恢复能力以及营养利用效率方面发挥着至关重要的作用，因此，肠道微生物群在保护生物学中具有巨大的应用潜力。近年来肠道微生物研究取得了诸多进展，然而，不同保护策略如何影响珍稀濒危动物肠道微生物生态系统及其代谢活动，目前尚不完全清楚。

森环森保所自然保护地与生物多样性学科团队综合宏基因组和代谢组分析方法，研究比较了湖北神农架国家公园（候选区）的野生、人工捕食和圈养三种不同保护情景下金丝猴的肠道微生物群落和粪便代谢组。该研究建立了一个全面的、针对特定物种的肠道微生物基因目录，并发现在不同保护策略下金丝猴的微生物和代谢的显著差异，包括在人工管理环境（圈养和人工捕食）中的金丝猴肠道微生物基因组目录比野生种群更大。虽然人工捕食组的α多样性最高，但与野生种群相比，圈养组和人工捕食组的微生物群落结构和共存网络均发生了显著改变，其中圈养组最显著的变化包括抗生素抗性基因（ARGs）和毒力因子（VFs）丰度等增加，微生物群-代谢物共变异模式发生显著改变，尤其是与氨基酸代谢相关的模式。这些发现为增强金丝猴等濒危灵长类动物的健康、长期生存能力和保护实践提供了重要见解。

该研究由森环森保所、中南大学和深圳易基因公司等单位共同完成，研究成果以“Multi-omic profiling reveals distinct gut microbial and metabolic landscapes in golden snub-nosed monkeys under contrasting conservation strategies”为题，于2025年11月发表在SCI期刊1区TOP期刊《npj Biofilms and Microbiomes》（IF=9.20）。森环森保所张于光研究员为论文通讯作者，研究得到了湖北省重点研究计划项目（2020BCA081）和国家重点研发计划课题（2013BAD03B02）等项目资助。