科研人员研发RNA转录本水平剪接调控预测模型
RNA剪接调控是多样转录本产生的核心过程，其调控模式影响转录本的序列、结构及功能特征。长读长转录组测序技术为解析同一基因中不同RNA转录本的相对比例、识别各类组织和细胞类型的特异表达转录本全长，提供了...
科研人员构建衰老数字人体全息框架
衰老是由分子到机体多层级复杂网络调控的系统性过程。微观扰动在网络中级联放大，驱动宏观衰退与慢病进展。受个体间健康储备差异与器官老化异步特性影响，同龄人老化速率呈现显著差异。生物技术与人工智能的发展，推...
研究揭示基于剪接功能异常的儿童急性髓系白血病耐药新机制
尽管治疗儿童急性髓系白血病的化疗方案不断优化，但仍有约30%的患儿在初始治疗后复发，且这类复发患儿的生存率极低。目前，耐药突变仅能解释部分患者对治疗产生耐药的原因，而大部分患儿产生治疗耐药的分子机制尚...
科研人员开发针对单细胞RNA测序数据的剪接分析新工具
RNA可变剪接是基因转录后调控的重要过程，其中蕴含转录本结构和功能多样性信息，是细胞转录异质性的重要来源。单细胞RNA测序技术因测序深度低、数据噪音及缺失率高等问题，在单细胞尺度精确量化可变剪接事件中...
研究开发出高效环形RNA检测与定量工具
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）高远团队与动物研究所赵方庆团队，开发出面向TB级转录组数据的高效环形RNA检测与定量工具CIRI3，通过反向剪接序列比对与跨样本整合算法设计，实现了...
研究揭示RNA聚合酶II精准解码“剪接密码”
在人类基因组中，超过95%的基因都含有内含子，这些非编码序列必须被准确剪除，才能生成具有功能的成熟mRNA。然而，基因组中存在大量“假剪接位点”，它们在序列上与真实的剪接位点高度相似，不具备真正的剪接...
甘蔗多组学整合数据平台发布
甘蔗是重要的经济作物，其基因组高度复杂，包含多倍体、高杂合性及非整倍体，且遗传背景狭窄，严重制约了基因功能解析与育种发展。近年来，甘蔗遗传学研究取得显著进展，亟需一个整合多维组学数据的资源平台，支撑提...
研究揭示染色质高级结构在细胞核内定位的调控机制
染色质在细胞核内的三维空间分布对基因表达调控、DNA复制和DNA损伤修复等生命基本活动至关重要。但是，传统的Hi-C技术仅能测量染色质片段间的相互作用频率，无法直接提供染色质形成的高级结构在细胞核内的...
研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制
DNA甲基化是调控基因表达的重要表观遗传机制，哺乳动物中主要发生在CG位点，复制后形成半甲基化状态，并由甲基转移酶维持。植物中DNA甲基化可发生在任意胞嘧啶，尤其在CG和CWG位点水平较高，且可能广泛...
研究开发出细胞身份鉴定新型AI引擎
随着单细胞和空间组学技术的快速发展，公开可共享数据量已突破亿级大关。然而，技术平台产生的差异、复杂疾病状态、跨物种研究带来的批次效应和离群细胞等，对数据解读构成挑战。面对动辄百万规模的离群细胞，传统的...