研究发现哺乳动物发育关键蛋白
哺乳动物受精卵的首次细胞命运决定,是发育生物学的核心科学问题,也关乎辅助生殖的胚胎质量评估。既往研究虽已揭示二细胞期非编码RNA LincGET介导命运偏倚,但调控该过程的关键蛋白因子尚未明确。 近日...
研究揭示植物RNA编辑因子的演化规律
RNA编辑是植物线粒体和质体中的一种转录后修饰,对植物生长、发育、抗逆等生理过程具有重要作用。该过程由核基因编码的五肽重复(PPR)蛋白、多细胞器RNA编辑因子(MORF)、细胞器RNA识别基序(OR...
研究阐明肿瘤转化正常成纤维细胞新机制
肿瘤细胞的恶性增殖是患者预后不良的关键因素。然而,肿瘤细胞擅长从肿瘤微环境中招募肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)。这些成纤维细胞需要深入肿瘤组织核心,提供促进肿瘤细胞生长的营养物质。那么,肿瘤细胞究竟依...
科研人员研发RNA转录本水平剪接调控预测模型
RNA剪接调控是多样转录本产生的核心过程,其调控模式影响转录本的序列、结构及功能特征。长读长转录组测序技术为解析同一基因中不同RNA转录本的相对比例、识别各类组织和细胞类型的特异表达转录本全长,提供了...
科研人员构建衰老数字人体全息框架
衰老是由分子到机体多层级复杂网络调控的系统性过程。微观扰动在网络中级联放大,驱动宏观衰退与慢病进展。受个体间健康储备差异与器官老化异步特性影响,同龄人老化速率呈现显著差异。生物技术与人工智能的发展,推...
研究揭示基于剪接功能异常的儿童急性髓系白血病耐药新机制
尽管治疗儿童急性髓系白血病的化疗方案不断优化,但仍有约30%的患儿在初始治疗后复发,且这类复发患儿的生存率极低。目前,耐药突变仅能解释部分患者对治疗产生耐药的原因,而大部分患儿产生治疗耐药的分子机制尚...
科研人员开发针对单细胞RNA测序数据的剪接分析新工具
RNA可变剪接是基因转录后调控的重要过程,其中蕴含转录本结构和功能多样性信息,是细胞转录异质性的重要来源。单细胞RNA测序技术因测序深度低、数据噪音及缺失率高等问题,在单细胞尺度精确量化可变剪接事件中...
研究开发出高效环形RNA检测与定量工具
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)高远团队与动物研究所赵方庆团队,开发出面向TB级转录组数据的高效环形RNA检测与定量工具CIRI3,通过反向剪接序列比对与跨样本整合算法设计,实现了...
研究揭示RNA聚合酶II精准解码“剪接密码”
在人类基因组中,超过95%的基因都含有内含子,这些非编码序列必须被准确剪除,才能生成具有功能的成熟mRNA。然而,基因组中存在大量“假剪接位点”,它们在序列上与真实的剪接位点高度相似,不具备真正的剪接...
甘蔗多组学整合数据平台发布
甘蔗是重要的经济作物,其基因组高度复杂,包含多倍体、高杂合性及非整倍体,且遗传背景狭窄,严重制约了基因功能解析与育种发展。近年来,甘蔗遗传学研究取得显著进展,亟需一个整合多维组学数据的资源平台,支撑提...