“零代码一站式”组学分析软件

近日,中国农业科学院烟草研究所烟草种质资源与生物育种创新团队为群体水平组学数据分析和可视化提供了“零代码一站式”解决方案,极大地促进了作物育种中多维组学大数据的高效挖掘和利用。相关研究成果发表在《植物通讯(Plant Communications)》上。

为降低多组学数据关联分析涉及的软件安装、数据清洗、质控、格式转换、参数调整等技术门槛,该科研团队开发了EasyOmics一站式分析软件,将传统需要数月学习的命令行操作转化为直观的图形界面。软件搭载八大核心模块,包含数据质控、遗传力评估到GWAS分析、组学数据关联分析、孟德尔随机化、数据展示等工具,完整覆盖组学研究全流程。内嵌智能参数推荐系统,即使缺乏统计学背景的用户,也能通过引导式操作完成复杂分析。研究者仅需点击鼠标即可完成转录组与蛋白质组等数据的关联分析,自动生成可直接投稿的矢量图。该软件支持Windows、macOS和Linux系统秒级部署。用户无需配置复杂环境,通过预装镜像即可实现“下载即用”,较传统方法节省大量的时间。

该研究得到国家自然科学基金等项目的支持。(通讯员 李晓娟)

原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590346225000550

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