微生物快速鉴定有了新技术
文章导读
传统微生物鉴定需要几天甚至几周的培养和比对，但你可能不知道的是，还有大量细菌因“难培养、难分类”至今无法被识别。最近，中国农业科学院团队用一项新技术打破了僵局——通过拉曼流式细胞分选技术，每0.5秒就能获取一个菌株的独特“指纹”图谱，结合深度学习模型，鉴定准确率高达96%以上。更关键的是，它首次实现了从“属”到“种”的精准区分，连水稻种子里的多种泛菌都能被逐一查清。这意味着曾经让你头疼的“培养不出来就无法鉴定”的困境，可能彻底成为历史。
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近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业微生物资源创新团队联合多家单位，在泛菌属细菌快速精准鉴定方面取得新进展。相关成果发表在《分析化学（Analytical Chemistry）》上。
该研究以在自然界中广泛存在的泛菌为研究对象，采用拉曼流式细胞分选技术，对其进行全方位快速扫读，每0.5秒即可获得一张菌株的特征性“指纹”图谱。同时结合深度学习模型，使泛菌的鉴定准确率提高到96%以上。研究人员对水稻种子进行细菌检测，成功查清了泛菌属的相对丰度，并进一步区分出多个关键泛菌种类，实现了从“属”到“种”的精准鉴定。该研究为“难培养、难分类”微生物的快速鉴定提供了新思路，为微生物的原位快速识别提供了新方案。
研究得到北方干旱半干旱耕地高效利用全国重点实验室、国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程等项目资助。
原文链接：https://doi.org/10.1021/acs.analchem.6c00276
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0.5秒一张图谱，这速度可以啊，不知道实际用起来成本高不高。