森环森保所在红树林重大害虫柚木驼蛾基因组研究中取得新进展

科研动态4天前更新 fcb067f5caaeb52f

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文章导读

你可能从未听过柚木驼蛾的名字，但它正悄悄啃食着我国红树林的命脉。这种害虫繁殖快、寄主广，过去十年频繁暴发，可我们却一直拿它没办法——不是因为药不行，而是根本搞不清它的“基因底牌”。我们曾以为防控靠的是喷药和监测，但实测发现，真正卡住防线的，是长达数年的基因信息空白。现在，首个染色体级基因组终于破译：394.93 Mb、97.73%完整度、31条假染色体被精准锚定。

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森环森保所在红树林重大害虫柚木驼蛾基因组研究中取得新进展

图1 柚木驼蛾基因组特征评估与Hi-C交互热图

森环森保所在红树林重大害虫柚木驼蛾基因组研究中取得新进展

图2 柚木驼蛾基因组特征Circos及其与近缘种的比较基因组学分析

柚木驼蛾(Hyblaea puera Cramer)原产于南亚和东南亚国家，其寄主范围广，繁殖和扩散能力强，目前已广泛分布于全球五大洲30多个国家和地区。近年来，该害虫在我国广西和广东等红树林分布区频繁暴发为害，对湿地生态安全构成严重威胁。长期以来，由于缺乏高质量的参考基因组信息，极大限制了对柚木驼蛾种群暴发机制、迁飞规律以及寄主适应性等关键科学问题的认知，在很大程度上也制约了精准高效防控技术的研发进程。

本研究综合运用Illumina、PacBio HiFi、Hi-C及RNA-seq等多种测序技术，成功获得了柚木驼蛾首个染色体水平的高质量参考基因组信息。最终组装获得的基因组大小为394.93 Mb，Contig N50达到11.49 Mb，BUSCO评估基因组组装完整度为97.73%。其中，96.97%的序列被锚定至31条假染色体上，与核型鉴定结果一致。全基因组重复序列占比为26.64%，共注释获得15,364个蛋白质编码基因，13,334个（86.79%）获得功能注释。该高质量参考基因组为解析柚木驼蛾的种群暴发机制精准防控策略的制定提供了重要基础。

上述研究结果以“Chromosome-level genome assembly of the teak defoliatorHyblaea pueraCramer (Lepidoptera: Hyblaeidae)”为题，于2026年3月发表在国际学术期刊《Scientific Data》上（中科院二区，IF=6.9）。森环森保所硕士研究生王子轩鑫和助理研究员孔德治为论文共同第一作者，曲良建研究员为通讯作者。该研究得到了“十四五”国家重点研发计划（2023YFC2604800）和中国林业科学研究院基本科研业务费专项资金（CAFYBB2024QF034）的资助。