TCGA（基因表达谱交互式分析）翻译站点

GEPIA（基因表达谱交互式分析）是基于TCGA和GTEx数据库的肿瘤和正常样本进行基因表达分析的有价值且被高度引用的资源。我们介绍了GEPIA2021，这是一个独立的扩展，为GEPIA提供了基于多重反卷积的分析。我们使用生物信息学工具CIBERSORT、EPIC和quanTIseq对TCGA/GTEx中的每个样本工具进行解卷积。根据每个散装RNA样本中推断的细胞比例，我们可以进行多个下游分析：

比例分析：使用交互式方框图可视化所选每种单元格类型的比例。用户可以对细胞类型或TCGA/GTEx子数据集之间的比例进行定量比较（ANOVA）。

相关性分析：同时可视化两种细胞类型的比例。用户可以根据皮尔逊相关系数进行定量比较。

亚表达分析：用交互式盒图可视化所选每种细胞类型中的基因表达，并进行细胞类型水平的差异表达分析。与比例分析类似，还可以使用方差分析进行微分表达式分析。

存活分析：根据所选细胞类型的比例将样本分为两组。然后用生存数据绘制每组的Kaplan-Meier曲线。曲线之间的统计差异可以通过对数秩检验来衡量。

详细的文档、使用示例和常见问题可以在帮助页面中看到。如果您遇到任何问题，请随时与我们联系以获得进一步的支持。

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