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中国科学院昆明动物研究所（以下简称昆明动物所）直属于中国科学院，是我国生物多样性演化、保护与可持续利用领域的综合性研究机构。

中国科学院光电技术研究所始建于1970年，是中国科学院在西南地区规模最大的研究所。建所以来，光电所在自适应光学、光束控制、微纳光学等领域取得了多项重大成就。

中国科学院重庆绿色智能技术研究院（以下简称“重庆研究院”）是中国科学院、原国务院三峡办、重庆市人民政府三方共建的中国科学院直属科研机构。

中国科学院成都山地灾害与环境研究所

设有生物多样性保护中心、生态环境修复中心、生物资源利用中心等3个研究部门，主办中文核心期刊《应用与环境生物学报》和被SCI收录的英文期刊《亚洲两栖爬行动物研究》。

根据中央建设创新型国家的总体战略目标和国家中长期科技发展规划纲要，结合科技布局调整的要求，围绕深圳市实施创新型城市战略，2006年2月，深圳市人民政府及香港中文大学友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院，实行理事会管理，探索体制机制创新。

中国科学院亚热带农业生态研究所自1978年任务建所以来，始终牢记使命，不断奋发进取，经过几代人的努力，为我国南方农业现代化道路的探索和亚热带区域农业可持续发展作出了重要贡献。

广州健康院深度推进科教融合。拥有生物学一级学科博士点、基础医学一级学科博士点、药物化学二级学科博士培养点，拥有生物医学工程一级学科硕士培养点、材料与化工和生物与医药两个领域的工程硕士专业学位培养点。

中国科学院广州地球化学研究所（简称“广州地化所”）的前身为中国科学院地球化学研究所于1987年整建制搬迁部分学科、研究室与原中国科学院广州地质新技术研究所合并成立的广州分部。

广州能源所定位是新能源与可再生能源领域的研究与开发利用，主要从事清洁能源工程科学领域的高技术研究，并以后续能源中的新能源与可再生能源为主要研究方向，兼顾发展节能与能源环境技术，发挥能源战略的重要支撑作用。

中国科学院南海海洋研究所重点研究热带边缘海海洋水圈－地圈－生物圈圈层结构及其相互作用特征与演变规律，探讨其对资源形成和环境变化的控制和影响，发展具有南海特色的热带海洋资源与环境过程理论体系和应用技术。以生态安全与绿色发展、海-陆-气相互作用与环境安全、边缘海与大洋板块相互作用和岛礁工程环境保障为战略主题，聚焦生态文明和国防安全建设工程，着力突破海洋领域前沿科学问题和关键核心技术。重点学科领域：热带海洋环境动力与生态过程、边缘海地质演化与油气资源、热带海洋生物资源可持续利用与生态保护和海洋环境观测体系及其关键技术。

中国科学院武汉植物园（以下简称“武汉植物园”）筹建于1956年，1958年正式成立，是集科学研究、物种保育和科普开放为一体的综合性科研机构，是我国三大核心科学植物园之一，包含光谷、磨山、中-非联合研究中心-肯尼亚园区，江夏、新洲两个基地及多个野外观测台站。